技术服务

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Multi-omics Services

多组学服务

高通量测序—转录组测序

真核无参转录组测序

合作交流

基于Illumina 测序平台,真核无参转录组测序采用Illumina Hiseq平台,对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有RNA进行测序,拼接出最长的转录本为unigene,以unigene为参考序列进行转录本拼接、注释,全面分析基因表达水平和结构信息。

实验流程



转录组测序

应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

▶ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

▶ 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

数据分析

转录本拼接组装基因表达水平定量
基因功能注释(7大数据库)样品间相关性分析
CDS预测基因差异表达分析
SNP分析、Indel分析差异表达基因功能富集分析
SSR分析差异表达基因的蛋白质互作网络分析
转录因子注释个性化分析

技术优势

▶ 样品类型广泛:动植物组织、微生物、细胞、外泌体等;

▶ 质控严格:严格的质量控制,及时与客户沟通RNA质检结果;

▶ 平台优,数据质量高:基于优质的Illumina测序平台,建库成功率>98%,数据质量高,Q30>85%;

▶ 分析内容丰富:个性化分析,联合分析,分析内容更丰富。

参考文献

1.

Prediction of a peptidome for the ecotoxicological model Hyalella azteca (Crustacea; Amphipoda) using a de novo assembled transcriptome. Mar Genomics. 2018

无参转录组测序技术-端足虫-通过对端足虫转录组分析,为生态毒理研究奠定良好的基础。

2.

De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus. BMC Evol Biol. 2017

无参转录组测序技术-鲸鱼-通过对灰鲸基因组和转录组分析,更好地了解鲸鱼的进化及其适应低氧环境的机制。

推荐技术

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