技术服务

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Multi-omics Services

多组学服务

高通量测序—转录组测序

真核有参转录组测序

合作交流

基于illumina测序平台,真核有参转录组测序可对真核生物特定组织或细胞在特定状态下转录的所有mRNA进行测序,通过与参考基因组比对,既可全面快速分析mRNA序列和丰度信息、又可对基因结构和新转录本进行分析。

实验流程


转录组测序

应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

▶ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

▶ 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

数据分析

基因结构水平分析基因表达水平分析
与参考基因组比对基因表达水平分析
可变剪切分析差异表达基因分析
新转录本预测GO/KEGG注释和富集分析
变异分析(SNP/ InDel分析)蛋白互作网络分析

技术优势

▶ 样品类型广泛:动植物组织、微生物、细胞、外泌体等;

▶ 质控严格:严格的质量控制,及时与客户沟通RNA质检结果;

▶ 平台优,数据质量高:基于优质的Illumina测序平台,建库成功率>98%,数据质量高,Q30>85%;

▶ 分析内容丰富:高级分析,联合分析,分析内容更丰富。

参考文献

1.

Personalized Proteome Profiles of Healthy and Tumor Human Colon Organoids Reveal Both Individual Diversity andBasic Features of Colorectal Cancer. Cell Reports . 2017

有参转录组技术-类器官-精准医疗-通过对类器官培养的结肠癌组织和癌旁组织进行转录组学和定量蛋白质组学分析,为个性化诊疗提供良好的依据。

2.

Oral secretions from Mythimnaseparata insects specifically induce defence responses in maize as revealed byhighdimensional biological data. Plant Cell Environ. 2016

有参转录组技术-玉米-生物胁迫-玉米受食草昆虫攻击的响应机制。

推荐技术

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