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翻译后修饰组—修饰蛋白定量分析

定量糖基化蛋白质组学

合作交流

糖基化是指蛋白质在酶的作用下被连接上糖链的过程。细胞内超过 50% 的蛋白质都修饰有糖链。连接于天冬酰胺(Asn)残基上的N-糖基化在真核生物中广为存在,也是研究最为深入的一种糖基化形式。蛋白质N-糖基化修饰主要在复杂的多细胞或组织形成过程中起关键作用,参与细胞识别、免疫应答、细胞分化等生命活动。 蛋白质经酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,再用N-糖酰胺酶(PNGase)在重水中切除糖链,然后通过LC-MS/MS对糖基化位点进行分析,实现大规模N-糖基化蛋白质定性定量分析。

实验流程



糖基化蛋白质,定量蛋白质组

应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

▶ 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;

▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

▶ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

▶ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

▶ 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

▶ 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;

▶ 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。

数据分析

蛋白质鉴定列表层次聚类热图(cluster)COG/KOG分析
肽段鉴定定量列表修饰位点统计绘图GO富集分析
修饰位点鉴定定量列表GO功能富集图KEGG富集分析
肽段保守motif分析列表KEGG通路图蛋白质互作网络分析
GO功能列表保守motif分析互作网络Module分析
KEGG信号通路Mapping表//

技术优势

▶ 鉴定通量高,一次最高可检测上万个N-糖基化修饰位点;

▶ 上万篇文献见证;

▶ 多组学分析:可联合代谢组学进行机制+表型方向的研究。

参考文献

1.

Comparative Analysis of Whey N-Glycoproteins in Human Colostrum and Mature Milk Using Quantitative Glycoproteomics. J Agric Food Chem. 2017

N-糖基化-初乳和成熟乳之间的营养价值。

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