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多组学服务

翻译后修饰—修饰蛋白定量分析

定量泛素化蛋白质组学

合作交流

泛素是一类在真核细胞中普遍存在的由76个氨基酸组成的高度保守小分子。泛素-蛋白酶体系统是细胞内绝大多数蛋白质降解的主要方式之一,因此蛋白质泛素化修饰是与蛋白质降解和功能调控密切相关的翻译后修饰形式,关乎蛋白质的老、病、死过程。蛋白质泛素化研究有助于了解细胞周期调控、增殖与分化、凋亡以及蛋白质周转代谢的机制。 利用对泛素化赖氨酸(K-GG)具有高亲和力的基序抗体,特异性富集复杂样本中的泛素化肽段,结合LC-MS/MS蛋白质定量方法,实现大规模泛素化蛋白质定性定量分析。

实验流程



泛素化蛋白质,定量蛋白质组



应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

▶ 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;

▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

▶ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

▶ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

▶ 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

▶ 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;

▶ 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。

数据分析

蛋白质鉴定列表层次聚类热图(cluster)COG/KOG分析
肽段鉴定定量列表修饰位点统计绘图GO富集分析
修饰位点鉴定定量列表GO功能富集图KEGG富集分析
肽段保守motif分析列表KEGG通路图蛋白质互作网络分析
GO功能列表保守motif分析互作网络Module分析
KEGG信号通路Mapping表//

技术优势

▶ 采用CST优质抗体,特异性高;

▶ 鉴定通量高,一次性检测上万个修饰位点;

▶ 上万篇文献见证;

▶ 多组学分析:可联合代谢组学进行机制+表型方向的研究。

参考文献

1.

Natural alleles of a proteasome α2 subunit gene contribute to thermotolerance and adaptation of African rice. Nat Genet. 2015

定量泛素化蛋白质组技术(label-free)-水稻幼苗-助力揭示非洲稻耐热机制,为水稻育种夯实理论基础。

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