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多组学服务

翻译后修饰组—修饰蛋白定量分析

定量磷酸化蛋白质组学

合作交流

蛋白质磷酸化修饰是生物体内最重要的共价修饰方式之一。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程调节着包括细胞增殖、发育、分化、信号转导、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩及肿瘤发生等过程在内的所有生命活动。在哺乳动物细胞生命周期中,大约有1/3的蛋白质发生着磷酸化修饰。 蛋白质磷酸化可以发生在多种氨基酸上,其中以丝氨酸 (S) 最多、苏氨酸 (T)次之、酪氨酸 (Y) 相对较少。(1) 利用金属氧化物TiO2或者金属螯合柱IMAC对磷酸基团的亲和能力可以实现对含有S, T, Y磷酸化肽段的富集,(2) 利用高亲和力酪氨酸磷酸化基序抗体可以特异性富集酪氨酸磷酸化肽段。上述两种富集方式结合LC-MS/MS蛋白质定量的方法,实现大规模磷酸化蛋白质定性定量分析。

实验流程



磷酸化蛋白质组,修饰蛋白质组


应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

▶ 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;

▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

▶ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

▶ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

▶ 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

▶ 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;

▶ 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。

数据分析

蛋白质鉴定列表层次聚类热图(cluster)COG/KOG分析
肽段鉴定定量列表修饰位点统计绘图GO富集分析
修饰位点鉴定定量列表GO功能富集图KEGG富集分析
KEGG通路注释统计表KEGG通路图蛋白质互作网络分析
GO功能列表保守motif分析互作网络Module分析
KEGG信号通路Mapping表//

技术优势

▶ 深度分析:最高一次性检测>25000个磷酸化修饰位点

▶ 结果验证:可基于PRM技术对定量结果进行验证

▶ 多角度分析:提供磷酸化修饰组+代谢组等多组学联合分析

▶ 质量与经验:国内最早提供磷酸化修饰组学分析服务的平台

▶ 多组学分析:可与代谢组学联合分析,提供机制—表型方向的研究路线

参考文献

1.

Quantitative phosphoproteomic and metabonomic analyses reveal GmMYB173 optimizes flavonoid metabolism in soybean under salt stress. MCP. 2018

iTRAQ磷酸化-研究GmMYB173转录因子优化盐胁迫下大豆黄酮类代谢调控机理。

2.

Quantitative Phosphoproteomic Analysis among Muscles of Different Color Stability using Tandem Mass Tag Labeling. Food Chemistry. 2018

TMT磷酸化-绵羊-肌红蛋白磷酸化蛋白调控羊肉肉色稳定性

3.

Label-free quantitative phosphoproteomic profiling of cellular response induced by an insect cytokine paralytic peptide. J Proteomics. 2017

label-free-磷酸化-家蚕脂肪体组织-研究家蚕麻痹肽信号关键调控因子

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