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翻译后修饰组—修饰蛋白定性分析

蛋白修饰表达谱分析

合作交流

随着质谱技术的灵敏度和分辨率的提高,样本分离分级方法进一步优化,PTM的测序深度不断增加。单就磷酸化而言,深度测序技术在人类、拟南芥等生物中已可坚定到6万多个修饰位点。而在其他PTM上的表达谱研究也不断刷新着研究者们的已有认知。这无不向我们展示出PTM表达谱巨大的研究潜力。

实验流程



蛋白修饰定性分析



应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 磷酸化:信号转导、细胞周期、生长发育及癌症机理等;

▶ 糖基化:蛋白质折叠、更新以及免疫应答等;

▶ 乙酰化:基因表达调控、细胞凋亡、细胞代谢、蛋白质稳定性以及神经退行性病变等;

▶ 泛素化:细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA修复以及信号转导等;

▶ 甲基化:染色质结构及转录调控等;

▶ 丙酰化 / 丙二酰化 / 戊二酰化 / 琥珀酰化:主要存在于线粒体和细菌中,与代谢过程密切相关。

数据分析

蛋白质鉴定列表修饰位点统计绘图
修饰位点鉴定列表GO功能富集图
肽段保守motif分析列表KEGG通路图
GO功能列表保守motif分析
KEGG信号通路Mapping表蛋白质互作网络分析

技术优势

▶ 采用CST优质抗体,特异性高;

▶ 鉴定通量高, 一次最高检测超过25000个磷酸化修饰位点;

▶ 上万篇文献见证。

参考文献

1.

N-glycosylation proteomic characterization and cross-species comparison of milk fat globule membrane proteins from mammals. Proteomics. 2016

构建哺乳动物乳汁脂肪球膜蛋白N-糖基化表达谱【客户文献】

2.

Comprehensive profiling of lysine ubiquitome reveals diverse functions of lysine ubiquitination in common wheat. Sci Rep. 2017

首次构建小麦泛素化表达谱,为小麦以及其他植物中赖氨酸泛素化提供研究基础。

3.

Phosphoproteomic analysis of chromoplasts from sweet orange during fruit ripening. Physiol Plant. 2014.

首次构建甜橙成色素细胞的磷酸化修饰谱,为了解磷酸化蛋白调控水果发育过程中成色素细胞的分化机理提供依据。

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