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多组学服务

蛋白质组—靶向蛋白质组

PRM (Parallel Reaction Monitoring)

合作交流

PRM(平行反应监视,parallel reaction monitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的靶向蛋白质组学技术,能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量。

实验流程



PRM,靶向蛋白质组,绝对蛋白质组


*包括目标肽段的质谱信号验证,与检测方法优化。


应用方向

▶ 验证定量蛋白质组学结果,验证翻译后修饰蛋白质组学结果;

▶ 目标蛋白质相对定量分析,目标蛋白质绝对定量分析;

▶ 诊断标志物靶向筛选;诊断标志物验证与绝对定量;验证基因表达产物。

数据分析

PRM定量用目标肽段及子离子列表目标蛋白候选肽段二级质谱匹配图
目标肽段PRM数据Skyline分析结果目标肽段PRM结果Skyline分析图谱
目标肽段PRM定量Skyline数据分析原始结果目标肽段PRM结果Skyline分析图谱
目标肽段和蛋白定量结果及统计分析/

技术优势

▶ 质量精度达到ppm级,能够比SRM/MRM更好地排除背景干扰和假阳性,有效提高复杂背景下的检测限和灵敏度;

▶ 对子离子进行全扫描,无需选择离子对和优化碎裂能量,更容易进行方法学建立;

▶ 更宽的线性范围:增加至5-6个数量级。

参考文献

1.

iTRAQ-based comparative proteomic analysis reveals tissue-specific and novel early-stage molecular mechanisms of salt stress response in Carex rigescens. Environmental and Experimental Botany. 2017.

iTRAQ+PRM+PCR-白颖苔草-盐胁迫【客户文献】

2.

Proteomics in plasma of ovariectomized rats and those exposed to estradiol valerate. J Steroid Biochem Mol Biol. 2017.

TMT+PRM-卵巢移除大鼠血浆-研究更年期综合征相关疾病【客户文献】

3.

Overgrazing induces alterations in the hepatic proteome of sheep (Ovis aries): an iTRAQ-based quantitative proteomic analysis. Proteome Sci. 2017.

iTRAQ+PRM-羊肝脏【客户文献】

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