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蛋白质组—定量蛋白质组

SILAC蛋白质组分析技术

合作交流

细胞培养氨基酸稳定同位素标记(Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture, SILAC),是2002年丹麦Mann实验室对AACT技术作进一步改进而获得,并开始应用于定量蛋白质组学研究,为全面、系统地定性和定量分析复杂哺乳动物细胞蛋白质组提供有效的解决方案。

实验流程



silac,蛋白质组


*可选择酶解后在肽段水平进行分析。


应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

▶ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

数据分析

蛋白质鉴定结果统计表蛋白质表达火山图
蛋白质定量结果统计表差异表达蛋白质聚类分析
GO功能注释统计表差异表达蛋白质GO注释分析
KEGG通路注释统计表差异表达蛋白质KEGG通路分析
/KEGG通路图详细展示
/差异表达蛋白质构建蛋白质互作网络图

技术优势

▶ 采用高分辨率质谱定量技术,定量结果准确且批次变异小、重复性好;

▶ Silac标记是在样品处理前引入,随后进行蛋白质分离、酶切和鉴定,后续实验对样品的影响一致,误差减少;

▶ Silac与SDS-PAGE或色谱分离技术相结合,兼容疏水性蛋白和偏碱性蛋白,不受蛋白质性质影响;

▶ Silac属于体内标记,标记效率高且稳定,不仅适合于进行全细胞蛋白质的分析,还适合于膜蛋白的鉴定和定量。

参考文献

1.

iTRAQ-Based Proteomic Analysis of Neonatal Kidney from Offspring of Protein Restricted Rats Reveals Abnormalities in Intraflagellar Transport Proteins. Cell Physiol Biochem. 2017.

iTRAQ-大鼠肾组织-产前营养对新生儿肾脏的影响【客户文献】

2.

iTRAQ-Based quantitative proteomic analysis reveals potential virulence factors of Erysipelothrix rhusiopathiae. J Proteomics. 2017.

iTRAQ-红斑丹毒丝菌-家畜养殖【客户文献】


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