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蛋白质组—定量蛋白质组

Label free 蛋白质组分析技术

合作交流

Label-free(蛋白质非标记定量技术)是通过LC-MS/MS技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用稳定同位素标签,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。

实验流程



label free,蛋白质组


*包括蛋白质定量、SDS-PAGE测试、酶解和质谱分析,对样本质量及样本之间的平行性进行初步判断。


应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

▶ 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;

▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

▶ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

▶ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

▶ 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

▶ 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;

▶ 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。

数据分析

蛋白质鉴定结果统计表蛋白质表达火山图
蛋白质定量结果统计表差异表达蛋白质聚类分析
GO功能注释统计表差异表达蛋白质GO注释分析
KEGG通路注释统计表差异表达蛋白质KEGG通路分析
/KEGG通路图详细展示
/差异表达蛋白质构建蛋白质互作网络图

技术优势

▶ 无需昂贵的同位素标签做内部标准,实验耗费低;

▶ 对样本的操作少,从而使其最接近原始状态;

▶ 不受样品条件的限制,克服标记定量技术在对多个样本进行分析方面的缺陷;

▶ 对实验操作稳定性、重复性要求高,要求至少做三次生物重复。


参考文献

1.

Tetrahymena thermophila Predation Enhances Environmental Adaptation of the Carp Pathogenic Strain Aeromonas hydrophila NJ-35. Front Cell Infect Microbiol. 2018.

label-free-研究四膜虫捕食增强嗜水气单胞菌的环境适应性【客户文献】

2.

Outer membrane vesicles containing signalling molecules and active hydrolytic enzymes released by a coral pathogen Vibrio shilonii AK1. Environ Microbiol. 2016.

label-free-珊瑚细菌外囊泡-生理生态功能【客户文献】

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