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蛋白质组—定量蛋白质组

iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)

合作交流

iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是一种多肽体外标记技术。该技术采用4-plex或8-plex同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,进行LC-MS/MS分析,可同时比较多种不同样本中蛋白质的相对表达含量。

实验流程



iTRAQ,蛋白质组


*包括蛋白质定量、SDS-PAGE测试、酶解和质谱分析,对样本质量及样本之间的平行性进行初步判断。


应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

▶ 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;

▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

▶ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

▶ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

▶ 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

▶ 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;

▶ 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。

数据分析

蛋白质鉴定结果统计表蛋白质表达火山图
蛋白质定量结果统计表差异表达蛋白质聚类分析
GO功能注释统计表差异表达蛋白质GO注释分析
KEGG通路注释统计表差异表达蛋白质KEGG通路分析
/KEGG通路图详细展示
/差异表达蛋白质构建蛋白质互作网络图

技术优势

▶ 具有2-8 plex标签,可同时标记2-8组样本进行表达差异分析;

▶ 是一种体外标记技术,可标记动物、植物、微生物、临床、体液或细胞等多种样本;

▶ 不同标签混合后上机,具有较好的平行性,避免技术误差,提高检测效率;

▶ 与凝胶方法相比,iTRAQ可发现膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白、强碱和强酸蛋白以及小于10KD和大于200KD的蛋白质,对低丰度蛋白质亦有较好的检出率。


参考文献

1.

iTRAQ-Based Proteomic Analysis of Neonatal Kidney from Offspring of Protein Restricted Rats Reveals Abnormalities in Intraflagellar Transport Proteins. Cell Physiol Biochem. 2017.

iTRAQ-大鼠肾组织-产前营养对新生儿肾脏的影响【客户文献】

2.

iTRAQ-Based quantitative proteomic analysis reveals potential virulence factors of Erysipelothrix rhusiopathiae. J Proteomics. 2017.

iTRAQ-红斑丹毒丝菌-家畜养殖【客户文献】


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