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蛋白组还不够?多组学联合分析来助阵!

2018-05-16

在系统生物学研究时代,生物学现象复杂多变,基因表达调控复杂多样,如果单纯用单一组学研究时结论往往会不够全面。不妨换个思路,将各组学的数据加以整合分析,或许会更深入的了解到生物学现象背后的作用机制。

那么我们今天就从转录组+蛋白组这个搭配开始说起……


何为?

转录组学和蛋白组学联合分析

转录组学和蛋白组学都是获得基因的表达情况的重要工具,从生物学角度上看,转录组代表了基因表达的中间状态,可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理;而蛋白是生物体直接的功能执行者,因而对其表达水平的研究有着不可替代的优势。要全面探究生物体疾病机理、胁迫机制,精确研究重要基因的表达模式和调控机理,只有联合转录组学和蛋白组学数据对生物样本进行系统研究,才能真正观察到mRNA-蛋白质关联性,进而从整体上解释生物学问题。


为何?

要做转录组学和蛋白组学联合分析


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如何?

进行转录组学和蛋白组学联合分析

在进行关联分析时,首先整合相同样本来源的转录组和蛋白质组数据,当某一个蛋白被鉴定到且在转录组水平有表达信息时,则认为基因和蛋白被关联到。接下来在表达量关联分析以及关联结果的功能注释和富集分析方面进行细致解析。


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● 关联结果部分展示:

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图(左) 转录组与蛋白组在定量和差异表达层面的关联数量venn图 

图(右) 所有定量蛋白及其关联的基因的表达量相关性散点图


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图 关联上的差异蛋白组和转录组表达模式聚类分析

表 五类关联类型的相关性系数统计     


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图(左) 富集关联GO条目(前20 个 GO 注释条目)
图(右) 蛋白组与转录组pathway富集显著性分布图



● 福利来了~

在农林和医学等研究领域,转录组学和蛋白组学技术都可交叉融合,深入揭示生物学现象背后的作用机制。同时也为基因的功能、代谢途径、宿主-微生物、微生物-环境互作等研究等提供新的研究思路。


为了更好的帮助大家更好的了解并应用多组学联合分析,中科新生命将在5.22下午14:00-15:20开设一场在线讲座《APT多组学联合分析强势来袭—转录蛋白联合搞事情


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讲座现场仅容纳100人,先到先得!

心动不如行动,说不定会有新的发现~


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